上古为烈山氏部落。《左传·昭公二十九年》载：“有烈山氏之子曰柱，为稷，自夏以上祀之。”

西周时期，今境封有曾国。

春秋战国时期，史籍记载有随国。考古证实，曾、随实为一国二名。曾国历史长达700余年。战国末楚改随国为随县，属楚，后入秦。楚惠王送曾侯乙镈钟铭文中曰“奠之于西阳”，由此可见，今曾都城区古地名为“西阳”。

秦，区境为随县，属南阳郡。

汉，区境为随县，属南阳郡。

三国，区境随县属魏国，隶属南阳郡。

东晋，区境为随县。

南北朝时期，建置多变，宋泰始五年（469）改为随阳郡；齐改随阳郡为随郡；梁为北随郡。区境随之变动。

西魏大统元年（535）升北随郡为随州。区境属随州，直至1979年。

隋开皇初年，废郡设州，随为州；大业初废州，改随州为汉东郡。

唐武德三年（620），改郡为州，随州属山南道。

五代之后梁、后唐、后晋、后汉、后周时，随为州，属山南东道。

宋为随州，隶属京西南路。南宋时，随州并入襄阳府路。

元为随州，领随县、应山县，隶属德安府。

明洪武元年（1368），降随州为县，属黄州府。洪武十三年（1380）复随州，属德安府。

清初仍为随州，属德安府。

中华民国时为随县，民国元年（1912）属湖北省。民国20年（1931）属湖北省第五行政督察区。民国26年（1937）后属湖北省第三行政督察区，专员公署驻县城。

1948年12月19日，随县第三次解放。

1949年5月，随州境内设随县、洪山县。随县隶属孝感专区;洪山县隶属襄阳专区。1952年6月，随县由孝感专区划入襄阳专区。1955年，洪山县并入随县。

1979年11月，国务院(国发〔1979〕269号)通知，设立随州市(县级)，同随县并存，隶属襄阳地区。随州市的行政区域包括原随县城关镇和城郊公社的31个大队。1980年7月1日，县、市分设建制。

1983年8月19日，国务院(国函〔1983〕164号)批准撤销随县，将原随县的行政区划并入随州市，为省辖县级市，由襄樊市代管。

1994年11月4日，湖北省人民政府(鄂政发〔1994〕152号)通知:随州市由省直管。

2000年6月25日，国务院(国函〔2000〕80号)批准:撤销省直辖县级随州市，设立地级随州市。随州市设立曾都区，以原县级随州市的行政区域为曾都区的行政区域。

2009年5月，国务院(国函〔2009〕35号)批准设立随县，以随州市曾都区19个乡镇为随县行政区域。曾都区继续保留，管辖区域包括原曾都区的淅河、万店、何店、洛阳、府河5个镇(其中淅河镇由随州高新区管委会代管)，东城、西城、南郊、北郊4个街道办事处，曾都经济开发区和城南新区2个管委会。2009年7月29日，新曾都区正式成立，区政府驻西城办事处烈山大道。

2022年1月28日，经省人民政府批准、省民政厅正式批复同意随州市曾都区设立涢水街道，辖区为原城南新区区域。

2023年12月5日，随州市委编委（随编发〔2023〕48号）通知：高新区不再代管淅河镇，由曾都区按照乡镇管理权限恢复对淅河镇的管理。

截至2024年，曾都区辖淅河、万店、何店、洛阳、府河5个镇，东城、西城、南郊、北郊、涢水5个街道，1个曾都经济开发区，村、社区经多次调整变更为65个社区居民委员会、148个行政村。